Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC105Q8IYK2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms