Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC6Q8IVU3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC6Q8IVU3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms