Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3FQ8IUX4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms