Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFNL1Q8IU54 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNL1Q8IU54 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms