Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS37DQ86XT2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms