Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms