Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD1L3Q7Z443 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD1L3Q7Z443 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms