Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT27Q7Z3Y8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms