Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDXQ7Z353 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDXQ7Z353 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HDXQ7Z353 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDXQ7Z353 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDXQ7Z353 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDXQ7Z353 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HDXQ7Z353 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDXQ7Z353 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDXQ7Z353 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDXQ7Z353 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDXQ7Z353 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDXQ7Z353 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDXQ7Z353 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms