Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms