Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
HECW1Q76N89 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms