Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
BRINP3Q76B58 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRINP3Q76B58 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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