Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms