Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CFAP47Q6ZTR5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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