Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
UBR3Q6ZT12 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms