Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms