Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAD2Q6PL18 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATAD2Q6PL18 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms