Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms