Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV7

CDPF1, Cysteine-rich DPF motif domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDPF1Q6NVV7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDPF1Q6NVV7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms