Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RINT1Q6NUQ1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RINT1Q6NUQ1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms