Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZM9

PRR27, Proline-rich protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR27Q6MZM9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRR27Q6MZM9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms