Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RCSD1Q6JBY9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms