Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms