Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A4Q6AI14 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC9A4Q6AI14 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC9A4Q6AI14 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC9A4Q6AI14 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC9A4Q6AI14 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms