Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA1Q5VX52 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms