Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRCH2Q5VUJ6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRCH2Q5VUJ6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRCH2Q5VUJ6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRCH2Q5VUJ6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRCH2Q5VUJ6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LRCH2Q5VUJ6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRCH2Q5VUJ6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms