Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms