Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms