Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms