Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms