Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO47Q5MNV8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms