Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC27A3Q5K4L6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A3Q5K4L6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
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