Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFHC2Q5JST6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC2Q5JST6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms