Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XKR3Q5GH77 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms