Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN4Q5BKX8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms