Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms