Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF6

HSP90AB4P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB4PQ58FF6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB4PQ58FF6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB4PQ58FF6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms