Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms