Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDCA8Q53HL2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDCA8Q53HL2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms