Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms