Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM3Q53FZ2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms