Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GREB1Q4ZG55 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms