Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRY2Q49AN0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms