Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP100Q494V2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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