Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL9Q3SXZ7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms