Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms