Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms