Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TWISTNBQ3B726 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms