Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LETM2Q2VYF4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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