Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms